Der Geruch der Fäkalien hängt hauptsächlich mit Fäulnisprozessen zusammen, die die aus der Darmresorption entweichenden Aminosäuren beeinträchtigen. Diese Nährstoffe werden tatsächlich von den Dickdarmbakterien abgefangen und durchlaufen einen Decarboxylierungsprozess, der die folgenden toxischen Amine produziert:
Arginin → Agmatin
Cystin und Cystein → Mercaptan
Histidin → Histamin
Lysin → Cadaverin
Ornithin → Putrescin
Tyrosin → Tiratina
Tryptophan → Indol und Skatol
Viele dieser Stoffe verleihen dem Stuhl einen besonders unangenehmen Geruch. Der Stuhl wird auch bei längerem Verbleib im Darm sowie bei den oben genannten Fällen von Malabsorption (Zöliakie, Pankreasinsuffizienz, Darminfektionen, Morbus Crohn, Colitis ulcerosa, Kurzdarmsyndrom, Mukoviszidose, Leber) eher übelriechend Erkrankungen der Gallenwege und des Magens, begleitet von Hypochlorhydrie). Wenn die Malabsorption hauptsächlich Protein ist, ist der Geruch des Kotes ekelerregend, während er scharf und durchdringend wird, wenn große Mengen von nicht absorbierten oder schlecht verdauten Zuckern und Stärken in den Dickdarm gelangen und dann von der lokalen Flora unter Produktion flüchtiger Fettsäuren fermentiert werden .
Durchfall und Kot des Vegetariers riechen schlecht.
Kot, der nach Fisch oder Sperma riecht, ist charakteristisch für die bakterielle Ruhr, Cholera und allgemein für Mukorrhö.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass der Geruch von Kot durch die Essgewohnheiten (Eiweißmenge, aromatische Lebensmittel wie Knoblauch oder Zwiebeln etc.), durch die Darmbakterienflora, durch den Gesundheitszustand und durch besondere Gewohnheiten (wie Rauchen oder Kauen) beeinflusst wird Tabak) Im Allgemeinen hilft der Verzehr kleiner und ausgewogener Mahlzeiten, ohne große Mengen "unverträglicher" Lebensmittel (siehe dissoziierte Ernährung) zu konsumieren, die Verdauungsprozesse zu optimieren, das Auftreten von Störungen wie Meteorismus und Blähungen zu reduzieren und die Stuhl einen sui generis Geruch.
Jeder Fall, in dem der schlechte Geruch des Stuhls von Symptomen wie schwarzem, teerigem oder blassem Stuhl, Blut im Stuhl, Fieber, Schüttelfrost, starken Bauchkrämpfen, reichlich vorhandenem Schleim im Stuhl und Gewichtsverlust begleitet wird.
